Die Ars Electronica Linz GmbH ist ein Teil der Unternehmensgruppe Stadt Linz. Das erste Festival fand 1979 statt, 1995 wurde die Ars Electronica Linz GmbH gegründet und ist seitdem für die Organisation und Durchführung des Ars Electronica Festival und des Prix Ars Electronica verantwortlich sowie für die Betriebsführung des Ars Electronica Center und des Ars Electronica Futurelab.
Subventionsgeber sind neben der Stadt Linz das Land Oberösterreich und die Republik Österreich. Geleitet wird die Ars Electronica Linz GmbH von Gerfried Stocker als künstlerischer und Diethard Schwarzmair als kaufmännischer Geschäftsführer.